Descendia dos rupertinos, importante família que dominava a região do médio e do alto Reno, e recebeu sua formação de cunho monástico irlandês. No ano de 700, foi impelido pelos mestres e sentiu-se impulsionado à pregação. Apoiado pelo conde Teodo de Baviera, fundou uma igreja dedicada a São Pedro. Pediu ao conde outro terreno perto do rio Salzach e construiu um mosteiro dedicado a São Pedro, o mais antigo da Áustria. Perto do mosteiro, surgiu um mosteiro feminino que foi confiado à abadessa Erentrude, sobrinha do santo. Ruperto é responsável pela conversão total da Baviera e de toda a Áustria. Morreu no dia 27 de março de 718, um domingo de Páscoa, depois de rezar a missa, no mosteiro de Juvavum. Suas relíquias estão guardadas na belíssima catedral de Salzburgo.